一般来说，企业对考试不及格员工直接扣款属于违法行为。依据我国劳动法，雇主严禁擅自扣除员工的薪资。工资应每月以货币形式支付给员工，禁止任何形式的克扣或拖欠行为。特殊情况下，若企业与员工在劳动协议中已就考试未过关引发的绩效减少进行明确约定，或者企业规章制度有明确且合理的规定，且该制度经民主程序制定并向员工公开，则此时的扣款或许并不违法，但仍需要保证被扣工资后员工的薪酬至少不低于所在地的最低工资水平。总而言之，判定是否违法需结合具体的约定及制度情况综合考虑。

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