6月27日凌晨，由南军第5军区的1990名士兵、460名联邦警察与270名联邦海关人员组成的联合部队，在空军战斗机与直升机的掩护下，向南奥南意边境出发，准备夺回边界通道;而另一路由110辆坦克组成的部队，则向斯洛文尼亚首都卢布尔雅那进发，其目标是控制该地的机场。

面对南人民军的坦克，斯洛文尼亚立即调动其地方防御部队与警察部队准备迎战，并在全国发布了总动员令。斯军在所有交通要道与城镇人口设置路障并构筑阵地，以阻止南军坦克的通过;同时斯洛文尼亚当局切断了南军在斯洛文尼亚境内各军营的水电与食品供应，解雇南军家属在当地的就业人员。

当天，南军与斯地方卫队首先在斯洛文尼亚东南部的奥尔莫日、新梅斯托发生冲突;随后在与奥地利接壤的一些边界过境站也发生了冲突。斯地方卫队还围攻了南人民军的两个军营与一个机场，击落了1架南军的直升机。在奥地利边境的卡拉瓦卡边境站，南军还进行了空降。当天，斯全国近20个地点发生了南军与斯地方卫队的战斗。

28日，冲突进一步扩大。斯地方卫队进一步围攻南军军营，而南军则在坦克进攻受阻后发起了空中打击。当天南军战斗机对斯地方卫队的14处阵地进行了轰炸，还攻击了卢布尔雅那与马里博尔的两座机场。当天下午，南国防部发表声明称，已经完全控制了斯境内的南斯拉夫国界。

6月29日起，优势开始转向斯洛文尼亚方面。双方仍然在斯各地不断交火。冲突主要发生在南军各被围军营的突围与解围战斗中。在斯洛文尼亚境内各分散的南军军营均遭到斯地方卫队围攻，在断电断水与失去食品供应的情况下处境艰难;而南军解围部队则受困于地理与路障，大批斯洛文尼亚与克罗地亚族士兵逃离部队也削弱了南军战斗力。在持续一周的冲突中，南军有36人阵亡，2500人被俘。

斯洛文尼亚的坚决抵抗出乎了南人民军与塞尔维亚的预料。尽管南军兵力与装备占压倒性优势，但是此时南境内已经是危机四伏，南军无法抽调足够的兵力形成绝对优势。在这种情形下，南军与塞尔维亚均意识到，斯洛文尼亚的独立已经不可逆转，南军继续在斯洛文尼亚用兵，或许能够一时压倒斯地方卫队，但是必将深陷其中。而南军身后还有一个克罗地亚，一旦克罗地亚准备完毕，则南军必将两面受敌。

而就斯洛文尼亚方面，南军的进攻同样也使其备受压力，此时南军的行动仍非常克制。在与南军坦克战斗机持续一周的战斗中，斯洛文尼亚方面仅有3名士兵、2名警察与5名平面死亡;一旦南军被彻底激怒，斯洛文尼亚的损失也将非常惨重。

此后直到7月初各地不断地有零星的战斗，然而由于与斯洛文尼亚同时宣布独立的克罗地亚境内塞尔维亚人与克罗地亚人冲突扩大，使得居中介入的联邦军队难以调度。此外斯洛文尼亚实行截断南斯拉夫联邦军补给线的行动，甚至不惜击落由斯洛文尼亚人所驾驶的联邦无武装直升机。在斯洛文尼亚国内对于南斯拉夫联邦军强烈的不支持也对战争形成了有利的状态，加上实行宣传战更让联邦变成了坏人一角，此时在欧洲各国的指摘声中7月2日南斯拉夫联邦军一部份的军队决定先撤退。

7月5日晚，在欧共体外长的调解下，斯洛文尼亚宣布接受停火条件，推迟3个月独立，拆除全部路障，遣散地方卫队，释放2500名南军被俘人员;而南军也宣布从斯洛文尼亚撤军。

7月7日，南斯拉夫联邦共和国和斯洛文尼亚共和国双方在欧洲共同体的出现下进行调停并且在布里欧尼岛(Brijuni)上面达成协议停火。南斯拉夫军队从斯洛文尼亚完全撤军，而卢布尔雅那当局暂缓三个月独立，两方都遵守协定。7月8日，斯洛文尼亚政府发表胜利宣言。

7月17日，双方在欧共体外长调解下谈判后确认了边境由斯洛文尼亚警察按南联邦法律管理，关税收入归联邦中央。斯洛文尼亚冲突暂告一段落。

斯洛文尼亚因为此役取得独立，取得长久以来所期盼的经济自主。斯洛文尼亚的经济在刚独立后那段时间，因为失去原本的南斯拉夫市场所以整体经济力量下降，之后积极的打入西欧的市场后开始成长。在1995年突破了一般被视为先进国家的门槛，也就是一人平均所得超过一万美元。塞尔维亚和克罗地亚也因为斯洛文尼亚的资金进出而开始经济活化。2004年时率先加盟欧盟，和同时加盟的捷克、斯洛伐克、匈牙利、波兰等国比起来斯洛文尼亚的经济能力维持着较高的水平，2007年1月1日进行货币整合开始采用欧元。

斯洛文尼亚是最先从南斯拉夫分离的国家，克罗地亚则因为独立不被承认而展开内战。因为有斯洛文尼亚独立的前例，所以鼓舞了之后波斯尼亚和黑塞哥维那和马其顿，成为他们也倾向独立的一个理由。