针对告知才处理和自诉案件的主要区别可概括为以下几个方面：
（1）案件结构呈现出显著差异；
（2）所产生的裁判结果迥然相异；
以及（3）裁判的主要依据亦存在显著差异。
【法律依据】
《刑事诉讼法》第二百一十二条，人民法院对自诉案件，可以进行调解；自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。本法第二百一十条第三项规定的案件不适用调解。 人民法院审理自诉案件的期限，被告人被羁押的，适用本法第二百零八条第一款、第二款的规定；未被羁押的，应当在受理后六个月以内宣判。