擅离军事职守罪既遂的处罚标准，一般是会被判处三年以下的有期徒刑的。擅离军事职守在造成严重后果的情况下，才会被追究刑事责任的，对于擅离军事职守的军人来讲，在没有造成严重后果的情况下，此时一般是会予以处分的。