农村邻里宅基地纠纷处理办法包括协商、调解以及向有资格处理纠纷的法院起诉等。至于具体哪些法院有案件的管辖权，可以结合法院的规定确定，若是想要起诉，最好是在诉讼时效被提交诉状。