在线处理房屋纠纷的程序主要如下：
先登入具备管辖权限的法院所属的电子诉讼平台（如“移动微法院”），接着完成真实身份注册及认证。
选择网上立案方式后，依据规定填写投诉书并上传房屋的所有权证明、合同以及相关的沟通记录等证据资料。
投诉书需详细注明原告与被告的个人信息、明确的诉讼请求内容以及事实依据。
提交立案申请之后，法院将对其进行审查。
若审核通过，将通知您缴纳诉讼费用，成功缴费即可视为立案完成。
若未能通过，则会反馈要求补充填写或更新材料。
值得注意的是，各地区的电子诉讼平台可能存在一定的操作差异，务必按当地法院的相关指引进行操作。

以上是律师的法律建议，如有疑问，欢迎进一步咨询。