在医疗事故中，患者可采取多种途径保护自身权益：
首先，与医疗机构自行协商解决；
其次，申请卫生行政部门介入处理；
最后，也可直接向人民法院提起诉讼。
若已被认定为医疗事故，卫生行政部门将根据双方当事人的请求，展开医疗事故赔偿调解工作。
【法律依据】
《医疗事故处理条例》第四十六条
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。