当农村房屋买卖合同被认定无效后，处理方式如下：

首先，双方应返还基于该合同取得的财产。买受人需将房屋返还给出卖人，出卖人则应返还买受人已支付的购房款及相应利息等。若房屋已发生增值或贬值，应根据具体情况合理确定返还的财产范围。
其次，对于因合同无效给对方造成的损失，应根据双方的过错程度来分担。如出卖人明知农村房屋不得转让而故意出售，应承担主要过错责任；
买受人在购买时未尽到合理的审查义务，也应承担一定的过错责任。双方应协商确定各自的赔偿数额，协商不成的，可通过诉讼途径解决。

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